电影《史前超人》讲述的是公元一万五千年前高度文明的亚特兰蒂斯大陆被一场大海啸掀入海底随后新的生命和文明再次在地球诞生明朝末年郑成功的副将唐文澜在大海中拾获装有亚特兰蒂斯王子的命运女神之匣并将婴儿收养为义子取名唐律唐律生来便具有亚特兰蒂斯人的超能力神的血脉让他的外貌始终维持在26岁的模样为了寻找圣石的下落唐律从欧洲回到2018年的中国与身世神秘的屌丝女记者朱安安相识朱安安无意中触发了引动圣石的媒介令她也拥有了某些常人不具的异能两人闹出各种匪夷所思的笑话与此同时国外某神秘机构的生化科学家、拥有黑暗力量的小矮人月见璃博士一直觊觎圣石并不惜一切代价找寻与亚特兰蒂斯有关的事物正邪大战一触即发……